赵永斌 ^* , 张兴政 , 刘剑锋 , 于长春

吉林师范大学生命科学学院, 四平, 136000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 15 篇   
收稿日期: 2019年01月22日    接受日期: 2019年01月29日    发表日期: 2020年05月20日

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SQUAMOSA 启动子结合蛋白家族作为一种转录调控因子广泛存在于植物中，起着调节生长发育及多种生理生化反应。目前，其编码基因已从多种植物中分离鉴定，但是在作为单子叶 C4 模式生物的青狗尾草中却尚未研究。本研究基于生物信息学方法，从青狗尾草全基因组中鉴定出 17 个 SBP 基因，对这些基因的结构、理化性质、染色体定位以及共线性进行分析，并且探讨了这些基因在不同组织的表达情况，此外，还对 SBP 蛋白质的基序和系统进化进行了分析。结果表明 17 个 SBP 基因分布于 9 条染色体上，其中 SvSBP1 与 SvSBP9、SvSBP3 和 SvSBP12、SvSBP4 和 SvSBP14 具有线性同源性，共有 11 个基因包含 miR156 结合位点。这些基因编码的 SBP 蛋白表现出不同物种的某些 SBP 蛋白之间较同一物种的 SBP 蛋白的遗传关系更近，暗示这些 SBP 家族成员的基本特征早在单双子叶植物分化之前就已经形成。SvSBP2、SvSBP8、SvSBP13、SvSBP17 在所有组织中都有表达，SvSBP15、SvSBP16 在所有组织中都不表达外，其余基因均在不同组织中特异性表达，其中花序分生组织中表达的基因数最多，暗示这些基因可能在青狗尾草花的形成中扮演重要角色，并与胁迫响应和叶片的生长发育相关。本研究为进一步鉴定基因功能、阐明青狗尾草生长发育的分子机理提供基础性信息。
 

青狗尾草(Setaria viridis)；SBP 家族；转录因子；生物信息学；表达分析